Organ upravljanja na Fakultetu je Savet Fakulteta. Članovi Saveta Fakulteta su osnivači, redovni i vanredni profesori, tri nenastavna radnika i četiri studenta.

Organi poslovođenja Fakulteta su dekan i prodekani. Fakultet ima četiri prodekana, od kojih tri nastavnika i jednog studenta.

Stručni organi Fakulteta su Nastavno-naučno veće i Izborno veće.

Delatnost Fakulteta organizuje se i obavlja u okviru organizacionih jedinica:

1. Organizacione jedinice nastavno-naučne delatnosti - katedre:

• Katedra studija bezbednosti
• Katedra studija odbrane
• Katedra studija civilne zaštite i zaštite životne sredine
• Katedra studija menadžmenta ljudskih i socijalnih resursa
• Katedra društveno-humanističkih nauka

2. Organizacione jedinice naučno-istraživačke delatnosti:

• Institut za bezbednosne studije
• Centar za istraživanje humane bezbednosti
• Centar za mirovne studije
• Centar za istraživanje sukoba
• Centar za bezbednosni menadžment
• Inovacioni centar
  

• Služba za zajedničke poslove
• Studentska služba
• Računovodstvo
• Studentski konsalting servis
• Biblioteka